Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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PTPRRQ15256 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PTPRRQ15256 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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