Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NECTIN1Q15223 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NECTIN1Q15223 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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