Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SEMA3AQ14563 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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