Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM29Q14134 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM29Q14134 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms