Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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COL4A6Q14031 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
COL4A6Q14031 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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