Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PDE6HQ13956 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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PDE6HQ13956 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PDE6HQ13956 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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