Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCINQ13939 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCINQ13939 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCINQ13939 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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CCINQ13939 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCINQ13939 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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