Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

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Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ITGA9Q13797 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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ITGA9Q13797 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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ITGA9Q13797 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGA9Q13797 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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