Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CDH18Q13634 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CDH18Q13634 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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