Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PDE3BQ13370 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE3BQ13370 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
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