Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGB3BPQ13352 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGB3BPQ13352 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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