Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXD4Q12950 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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