Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
STX4Q12846 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms