Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMARCB1Q12824 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMARCB1Q12824 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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