Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TROQ12816 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TROQ12816 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TROQ12816 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TROQ12816 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TROQ12816 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TROQ12816 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TROQ12816 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TROQ12816 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
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