Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCNMA1Q12791 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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