Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SMAGPQ0VAQ4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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SMAGPQ0VAQ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMAGPQ0VAQ4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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