Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLFN5Q08AF3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLFN5Q08AF3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms