Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PSME1Q06323 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PSME1Q06323 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms