Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN12Q05209 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN12Q05209 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms