Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UBXN1Q04323 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms