Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TNFRSF17Q02223 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms