Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
DEFA6Q01524 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms