Protein–RNA interactions for Protein: P98177

FOXO4, Forkhead box protein O4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO4P98177 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXO4P98177 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms