Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COG7P83436 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG7P83436 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG7P83436 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG7P83436 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
COG7P83436 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
COG7P83436 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COG7P83436 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COG7P83436 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COG7P83436 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms