Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPNP63162 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPNP63162 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms