Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RHOBP62745 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms