Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ARF6P62330 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ARF6P62330 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms