Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPD2P62316 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPD2P62316 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms