Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COPZ1P61923 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COPZ1P61923 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms