Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HERVK_113P61574 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms