Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPS3AP61247 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RPS3AP61247 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms