Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ERVPABLB-1P60509 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms