Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF3P57682 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF3P57682 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLF3P57682 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms