Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SOX10P56693 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SOX10P56693 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX10P56693 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX10P56693 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX10P56693 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SOX10P56693 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SOX10P56693 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX10P56693 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX10P56693 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX10P56693 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX10P56693 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX10P56693 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOX10P56693 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms