Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CTBP2P56545 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTBP2P56545 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms