Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CASP9P55211 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP9P55211 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP9P55211 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP9P55211 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP9P55211 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP9P55211 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP9P55211 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CASP9P55211 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CASP9P55211 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms