Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATN1P54259 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms