Protein–RNA interactions for Protein: P53675

CLTCL1, Clathrin heavy chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCL1P53675 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCL1P53675 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCL1P53675 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCL1P53675 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCL1P53675 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTCL1P53675 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTCL1P53675 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms