Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PGGT1BP53609 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PGGT1BP53609 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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