Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
EFNA4P52798 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EFNA4P52798 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms