Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PGDP52209 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PGDP52209 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PGDP52209 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PGDP52209 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PGDP52209 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PGDP52209 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms