Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
UBE2E1P51965 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms