Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PPT1P50897 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPT1P50897 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms