Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRE11P49959 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRE11P49959 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRE11P49959 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRE11P49959 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms