Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NRIP1P48552 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms