Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NEDD4P46934 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NEDD4P46934 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms