Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCAMP43121 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCAMP43121 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms