Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CEACAM3P40198 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CEACAM3P40198 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms