Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FDFT1P37268 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FDFT1P37268 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms